La automatización es el conjunto de sistemas fijos que ejecutan de forma autónoma el movimiento, la clasificación y la preparación de mercancía en el almacén, como transportadores, clasificadoras, transelevadores y líneas de picking automatizado.
Se diferencia de la robótica de almacén, que emplea máquinas móviles como AGV o AMR, y de la integración de sistemas, que diseña el proyecto combinando componentes de varios fabricantes sin fabricarlos necesariamente. El almacén vertical automatizado es un ejemplo de instalación que combina varios de estos sistemas.